Te recomiendo que comprimas los videos al pasarlos a .avi o .mpeg, aunque se vean algo pero. es que si no los comprimes una archivo de 5 megas en .mov te va ocupar 200 en .avi
Un buen programa convertidor de videos es "Ashampoo Movie Shrink & Burn 2". Además está en castellano. A mí me funciona muy bien a la hora de convertir los formatos.